مرکز تحقیقات ایمونولوژی مولکولی در تاریخ 1386/5/15 با اخذ موافقت اصولی از شورای گسترش دانشگاه علوم پزشگی تهران معاونت تحقیقات و فناوری تاسیس و در تاریخ1393/6/8موافقت قطعی را دریافت نمود.

هم اکنون این مرکز یک از مراکز فعال در رده بایومدیکال با بیش از سه سال فعالیت پژوهشی و فاقد ردیف مستقل بودجه می باشد.

اگرچه فعالیت های پژوهشی این مرکز در اساسنامه شامل  سه لاین پژوهشی ایمونوژنتیک ، پیوند و سلول های بنیادی می باشد علاوه بر این موارد پژوهش های مربوط به بیماری های خود ایمن و مرتبط با محیط زیست نیز در لیست فعالیت های این مرکز قرار دارد.

مرکز تحقیقات ایمونولوژی مولکولی به ریاست جناب آقای دکتر محمد حسین نیک نام و معاونت پژوهشی خانم دکتر نرگس سلیمانی فر و اعضای محترم شورای پژوهشی مشغول به فعالیت می باشد.